ジェダイ評議会が派遣したメイス・ウィンドゥ、アナキン・スカイウォーカー、オビ=ワン・ケノービ、分離主義勢力によるグリーヴァス将軍、ダース・モール、そして謎のシス卿の指揮のもと、銀河共和国グランド・アーミーと分離主義勢力のドロイド軍によるジオノーシスの戦いが始まった。戦場の制圧地点を確保し、アップグレードして強力な軍隊を構築し、この大規模な戦闘で敵の司令部を破壊し、完全な勝利を目指せ！